A previous metagenomic analysis of the turkey gut RNA virus community identified novel enteric viruses that may play roles in poultry enteric diseases or in performance problems noted in the field. As part of the molecular characterization of these novel enteric viruses, a reverse transcriptase–PCR diagnostic assay was developed, targeting a novel turkey-origin picobirnavirus (PBV) initially identified in a pooled intestinal sample from turkey poults in North Carolina. Little detailed molecular information exists regarding the family Picobirnaviridae, particularly for the PBVs that have been described in avian species. This diagnostic assay targets the turkey PBV RNA-dependent RNA polymerase gene and produces an 1135-bp amplicon. This assay was validated using in vitro transcribed RNA and was tested using archived enteric samples collected from turkey flocks in the southeastern United States. Further, a phylogenetic analysis suggests the turkey PBV is unique because it does not group closely with the recognized PBV genogroups circulating in mammalian hosts.

Nota de Investigación—Análisis molecular y filogenético de un nuevo Picobirnavirus originado en pavos.

Mediante un previo análisis metagenómico de una comunidad de virus ARN intestinales de los pavos, se identificaron nuevos virus entéricos que pueden ser importantes en las enfermedades entéricas de las aves comerciales o en los problemas en la productividad observados en el campo. Como parte de la caracterización molecular de estos nuevos virus entéricos, se desarrolló un ensayo diagnóstico de transcripción reversa y PCR, dirigido a un picobirnavirus nuevo de origen en los pavos (PBV), que fue inicialmente identificado en un grupo de muestras intestinales combinadas de pavos de Carolina del Norte. Existe poca información molecular detallada sobre la familia Picobirnaviridae, en particular para los picobirnavirus que han sido descritos en las especies aviares. Este ensayo de diagnóstico está dirigido al gene de la polimerasa de ARN dependiente de ARN del picobirnavirus de los pavos y produce un amplicón de 1135 pares de bases. Este ensayo fue validado utilizando ARN transcrito in vitro y se puso a prueba utilizando muestras entéricas archivadas que fueron recolectadas de parvadas de pavos en el sureste de los Estados Unidos. Los análisis filogenéticos posteriores sugieren que el picobirnavirus de los pavos es único, ya que no se agrupa estrechamente con los genogrupos de picobirnavirus reconocidos que circulan en huéspedes mamíferos.